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研究人員鑒定出結(jié)腸癌中的基因突變網(wǎng)絡(luò)

   日期:2017-12-09     瀏覽:96    
核心提示:發(fā)布日期:2017-12-08 韓國高等科學(xué)技術(shù)學(xué)院(KAIST,Korea Advanced

發(fā)布日期:2017-12-08

韓國高等科學(xué)技術(shù)學(xué)院(KAIST,Korea Advanced Institute of Science and Technology)的研究小組鑒定出結(jié)腸腫瘤發(fā)生的基因網(wǎng)絡(luò)原則。這些原則未來將被用于尋找有效抗癌藥物的分子靶點。而且,該研究因為使用了系統(tǒng)生物學(xué)的方法得到人們的關(guān)注,系統(tǒng)生物學(xué)恰恰是生物技術(shù)(BT)和信息技術(shù)(IT)的綜合研究領(lǐng)域。

KAIST生物和腦部工程系Kwang Hyun Cho教授領(lǐng)導(dǎo)的研究小組成功地開展了這項研究;研究人員包括Dongkwan Shin博士以及學(xué)生研究員Jonghoon Lee和Jeong Ryeol Gong。11月2日,《自然通訊》(Nature Communications)雜志在線發(fā)表了此項研究結(jié)果。

人類癌癥是由基因突變引起的?;蛲蛔兊念l率因癌癥的類型各異而不同------例如,白血病和兒童癌癥中只有大約10個突變;但是在成人實體癌中平均有50個突變;由外部因素引發(fā)的癌癥甚至包含數(shù)百個突變(如肺癌)。

世界各地的癌癥研究人員正在努力識別病人體內(nèi)經(jīng)常發(fā)現(xiàn)的基因突變,進(jìn)而發(fā)現(xiàn)重要的癌癥誘導(dǎo)基因(稱為“驅(qū)動基因”),用來開發(fā)抗癌藥物的靶點。然而,基因突變不僅影響其自身功能,而且通過相互作用影響其他基因。因此,現(xiàn)在的治療方法局限于靶向少數(shù)癌癥誘導(dǎo)基因,而沒有進(jìn)一步了解基因網(wǎng)絡(luò),所以目前的藥物只在少數(shù)患者中有效,并且常常導(dǎo)致耐藥性。

Cho教授的研究小組利用癌癥患者的大規(guī)模基因組數(shù)據(jù),建立了有關(guān)基因相互作用網(wǎng)絡(luò)中多個基因突變協(xié)同效應(yīng)的數(shù)學(xué)模型。該模型構(gòu)建的基礎(chǔ)是國際癌癥基因組聯(lián)盟提出的癌癥基因組圖譜(TCGA)。研究小組成功地通過臨床特征,量化了基因網(wǎng)絡(luò)突變對結(jié)腸癌患者群體的影響。

而且,研究人員利用大規(guī)模計算機模擬分析,鑒定了腫瘤發(fā)生過程中的關(guān)鍵轉(zhuǎn)換現(xiàn)象,這是第一個被識別的隱藏的基因網(wǎng)絡(luò)原理。臨界相變是物質(zhì)通過相變突然變化的現(xiàn)象。過去,人們無法確定是否存在轉(zhuǎn)換現(xiàn)象,因為在腫瘤發(fā)生過程中很難追蹤基因突變的序列。 該研究小組采用了基于系統(tǒng)生物學(xué)的研究方法發(fā)現(xiàn),如果已知的“驅(qū)動基因”突變順序地緊隨其后,那么結(jié)腸癌腫瘤的形成就會顯示出一個關(guān)鍵的轉(zhuǎn)換現(xiàn)象。研究小組利用自主開發(fā)的數(shù)學(xué)模型,可能研發(fā)出一種新的抗癌靶向藥物,能夠最有效地抑制,在癌癥患者當(dāng)中發(fā)現(xiàn)的許多基因突變的影響。特別是,研究人員不僅可以評估“驅(qū)動基因”,而且可以評估受基因突變的影響的其他“乘客基因”,以便找到最有效的藥物靶標(biāo)。

Cho教授說:“人們對腫瘤發(fā)生過程中許多基因突變的作用知之甚少。”他繼續(xù)說,“在這項研究中,系統(tǒng)生物學(xué)方法首次發(fā)現(xiàn)了基因網(wǎng)絡(luò)的原理,從一個新的角度提出了抗癌藥物靶點識別的可能性。” 這項研究是由韓國科學(xué)信息通信技術(shù)部(Ministry of Science and ICT)和韓國國家研究基金會(NRF)資助的。

來源:韓國科學(xué)技術(shù)院

 
 
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